高等教育評鑑中心公布的系所評鑑，包括東吳和銘傳共8校。266個系所共455個班制中，沒有「未通過」者，「通過」達9成3，「待觀察」有30班制，研究所占8成3。評鑑中心執行長陳振遠說，系所評鑑各大學「自己與自己比」，不過重點為「教學」，而非以「研究」為標的，以教學為主的逢甲、高醫大、銘傳等成績很好，反倒是成大等研究型大學待觀察系所較多。

他表示，首度有2大學受評系所全數通過，其中逢甲連續3年獲教學卓越計畫補助金額第一名；高醫大推動教學品管圈管考機制；有2班制「待觀察」的東吳，4年來教學卓越計畫金額都超過 1億；1班制「待觀察」的銘傳則獲美國中部各州校院高等教育評審會認證。

陳振遠指出，成大、中央等研究型大學，論文質量等成果亮麗，但不少新設獨立系所，因為師資員額、空間不夠，加上教育目標太高，成大有13班制、中央9班制、交大3班制待觀察。

其他原因還包括博士班與碩士班開設同一套課程沒有區分、博士班缺乏核心課程、系所偏離以「教學」為重點評鑑方向、評鑑資料準備不足等。

教育部次長林聰明強調，拿到5年500億補助的研究型大學，研究、教學和服務都要兼顧，研究有成果，也要保證教學品質， 3位老師就成立一所的情形很普遍，希望透過這次評鑑導正。

他說，5年500億考核看的是大學研究成果，但系所評鑑結果，也會給審核委員參考。