教育部不開放大陸醫事類科的學歷認證，除擔心醫師人力過剩、素質不良、影響國民健康等問題，還包括醫事人員應經教、考、用三階段，在實習場所容量有限情形下，暫不宜開放。

吳妍華認為，大陸與台灣的醫事學制不同，五、六、七年制都有，不易等化，也不像台灣的醫學系都經醫學教育委員會審核，管得很嚴，「美國有不少人考不上美國醫學院，就去墨西哥、巴西、波蘭念，但要回美國執業的檢覈很嚴。」

也有人認為，如果去大陸學醫的學生能通過國內醫師考試，就代表有能力行醫，不應限制。但吳研華認為，有沒有當醫生的能力，不是光靠考試就可看出，還要考量文化因素。

中國醫大校長黃榮村也認為，大陸與台灣的醫事學制不同，是承認大陸醫事學歷的障礙。黃榮村說，台灣的醫學教育水準不錯，應該也有大陸學生想來念，但醫學系也是多數本地生第一志願，在資源有限的條件下，應優先保障本地生的就學權益。