不過，北京市府及市文物局官員透露，北大校園大規模拆遷和建設「國際數學研究中心」因事關重大，來自各階層的反應強烈，北京市府決定暫停審批，近期將組織專家論證。

對於北京市府決定，北大方面表示不知情。相關人員表示，校方已按照法定程序逐級申報，現在尚未進行到拆遷階段，離拆遷還有相當距離。

根據史載，北大校園內曾有八座古園林，三座已被徹底毀壞或改造，現尚存五座。此次拆遷工程將拆遷的「朗潤園」，是清道光年間奕訢的園子，「鏡春園」為清嘉慶年間莊靜公主的園子。今年一月，海澱區建委和北大校方公布上述兩座園子將大規模拆遷後，引起各方關注，擔心北大原有的古建築面貌和景觀受到影響。

北大為此特別舉行記者會，向外界說明拆遷區域的情況，以及拆遷工程的目標和做法。校方一再保證，將會遵循文物保護法規，保護文物，不會破壞古建築。

北大校方指出，一九五○年代以來，朗潤、鏡春園一帶出現大量簡陋的臨時生活住房，與古園面貌不協調。北大此次徹底整治該區，目的在拆除區內的簡陋臨時用房，將生活區遷出，修繕和修復古建築，同時整治駁岸水系，還原歷史面貌。用於兩園環境整治和文物建築維修的費用，預算是八千三百多萬元人民幣。

朗潤、鏡春園一帶有九十九戶住戶、兩百零三間房屋，建築面積約四千二百平方公尺需要拆遷，有近卅戶需要搬遷。大學發展規劃部副部長呂斌在會上表示，根據規劃，朗潤、鏡春兩園內的居民將全部遷出，現占園內總面積百分之七十的臨時建築將被全部拆除。

由於拆遷區域大多是在北大工作的中下層職工居住，這些居民不願意遷出，已有反抗情緒出現。北大校方表示，會做好安撫和安置居民工作。